閉塞性肥大型心筋症に対する手術の全体的な成功率は、患者の状態、疾患の重症度、受けた医療のレベルにもよるが、80％以上である。
症候性閉塞性肥大型心筋症の患者に対しては、薬物療法が治療の第一選択である。 最大量の薬物療法を行ってもなお心不全症状が顕著な場合には、心室間隔膜切開術や心室中隔アルコールアブレーションなどの外科的治療が必要であり、心室間隔膜切開術の成功率は90～95％、心室中隔アルコールアブレーションの手術後の成功率は80～90％であるという研究報告がある。
僧帽弁閉鎖不全を合併した場合、一般に心室中隔筋切開術は術後すぐに効果が得られ、持続的な効果が得られるが、心室中隔アルコールアブレーションは最大3ヵ月間効果が遅れる。 両手術にはそれぞれ長所と短所があり、専門医が患者の実際の状態を考慮して手術計画を立てる必要がある。
肥大型心筋症は遺伝性の心筋疾患であり、左室流出路閉塞が生じると、呼吸困難、倦怠感、胸痛、失神などの症状が出現する。 家族に病歴のある人、上記のような臨床症状のある人は、重篤な事態を避けるため、できるだけ早く医療機関を受診することを勧める。