原因はまだ解明されていませんが.一般的には.遺伝的要因.環境要因.感染要因.免疫要因が相互に作用して発症すると考えられています。 (遺伝的要因 強直性脊椎炎は.家族のうち2人以上に発症することが多い。 家族調査の結果.強直性脊椎炎の人の親族一代では.強直性脊椎炎のリスクが一般の人の20～40倍であることがわかりました。 双子を対象にした調査では.一卵性双生児では.もう一人の双子が発症する確率が50％以上であることがわかりました。 (最近の研究では.本疾患の発症は感染症との関連が示唆されている。強直性脊椎炎患者の便培養は.健常者の30％に対し79％が肺炎桿菌（Klebsiella pneumoniae）陽性であり.患者における肺炎桿菌の感染頻度は健常者に比べ有意に高いことが示唆されている。 血清中の抗Klebsiella pneumoniae抗体濃度も.健常者の4.4％に対し.強直性脊椎炎患者では43.3％と有意に高いことが判明した。 強直性脊椎炎の治療においてスルファサラジンがより有効であることは.腸管感染症と強直性脊椎炎の関係をさらに裏付けるものとなっています。 （HLA-B27遺伝子はMHCクラスIに属し.DNAタイピングにより15のサブタイプが同定されている。 強直性脊椎炎はB2704.B2705.B2702と正の相関.B2709.B2706と負の相関を示すことが疫学データから示唆されており.これはB27分子のある部分のアミノ酸配列の違いに起因していると思われる。 (iv) その他の要因 年齢.体格.栄養失調.気候.土壌.水分.寒さ。 その他.外傷.副甲状腺疾患.上気道感染症.局所的な敗血症性感染症などは.この病気と何らかの関連があると思われるが.証拠は不十分である。