胆道閉塞後（特に完全閉塞の場合）.胆汁およびその成分の多くが腸に流入できなくなるため.管内圧の上昇.肝血流の変化.体内の一連の生化学的.免疫学的.肝.腎.代謝的変化が起こり.その特徴や程度は.胆道閉塞の部位や期間.閉塞の程度.併発の有無によって異なる。 肝細胞のアポトーシスは胆道閉塞の延長とともに増加し.肝障害や肝機能障害も閉塞の延長とともに増加し.アポトーシスはそれと正の相関がある。 閉塞性黄疸は胆汁の流出障害によって引き起こされ.肝細胞障害の主な原因であり.しばしば肝硬変.肝不全.死に至る。 肝臓に胆汁酸塩が蓄積すると.肝細胞や胆管細胞にアポトーシスが誘導され.過剰なアポトーシスは抗アポトーシス異常を引き起こし.肝線維症の異常増殖を招き.これも肝障害の主な原因となる。 胆道閉塞時の胆道内圧の上昇に伴い.胆汁の逆流が起こり.肝類洞内圧が著しく上昇し.門脈圧および肝動脈抵抗が上昇し.肝臓への血流が減少し.肝細胞の相対的虚血.低酸素症を引き起こし.肝病理学的変化を悪化させる。 同時に.胆汁酸塩が胆管を通って腸内に排出されなくなり.腸内細菌に対する胆汁酸塩の抑制作用が発揮できなくなり.その結果.腸内エンドトキシンの繁殖が促進され.細菌叢の機能不全.G_2C菌数の著しい増加.エンドトキシンの産生が増加する。この時.腸粘膜のバリア機能が低下し.エンドトキシンと細菌が門脈を介して肝臓に移行し.肝臓のクッパー細胞の機能が低下し.エンドトキシンのクリアランス能力が低下する。 上記の原因が複合的に作用することで.肝細胞の超微細構造の変化.核形態異常.固形物の収縮.ミトコンドリアの膨潤.クリスタの消失.破砕.胆管内の均一物質.脂質貯蔵細胞.小胞体の減少.クッパー細胞の増加・膨潤が起こる。 さらに.閉塞性黄疸では全身の免疫機能の低下がみられ.特に細胞性免疫機能において顕著である。 腫瘍による胆管の狭窄と閉塞は.ビリルビンと胆汁酸の血中への還流をもたらし.高ビリルビン血症と胆汁酸血症を引き起こす。 研究によると.胆管閉塞が1～2週間で.内毒素血症が明らかでない場合.心筋細胞.肝細胞.腎細胞にミトコンドリアの膨潤.変形.クリスタの消失などがみられ.閉塞2週間の流行では筋フィラメントの障害がみられる。 この時.血中胆汁酸濃度は有意に上昇し.胆汁酸ナトリウムの経管栄養により胆汁酸濃度は胆道閉塞2週間の平均濃度になり.心筋にも同様の超微細構造変化がみられた。 このことは.閉塞性黄疸における胆汁酸のうっ滞が.心筋などの臓器や組織の超微細構造を損傷することを示唆している。