脂肪肝は独立した原疾患の場合もあるが.肝臓が関与する全身性疾患の症状として現れることが多い。 肝臓に脂肪が過剰に蓄積される原因は様々で.その影響範囲や関係性はまだ十分に解明されていません。 臨床的には.脂肪肝の原因として.過度の飲酒.肥満.糖尿病.高脂血症.飢餓.高脂肪・低蛋白食.蛋白・カロリー欠乏栄養.高エネルギー栄養剤の点滴療法.小腸迂回手術.テトラサイクリン.四塩化炭素.黄燐.アミオダロンなどの薬剤や産業毒.肝炎ウイルス感染（特にC型肝炎ウイルス感染）.妊娠中の急性脂肪肝.ライ症候群.内分泌代謝異常.B型肝炎等が一般的である。 ライ症候群.内分泌代謝異常（例：コルチゾル症.甲状腺機能亢進症.長期間のグルココルチコイド療法）.いくつかの慢性感染症や炎症性疾患（例：炎症性腸疾患.慢性結核）など。 脂肪肝の原因.臨床症状.予後の構成比は.時代や国.集団によって異なる。 例えば.3年間の自然災害の期間中.中国では栄養失調による脂肪肝が農村部の住民に特に多く見られました。 近年.経済レベルが向上し.脂肪分の多い食品やアルコールの摂取が増えたため.上海などの先進地域では肥満.糖尿病.高脂血症が脂肪肝の主な原因となっているが.北部や少数民族地域では脂肪肝は主にアルコール依存症が原因であるとされている。 飲酒.肝炎ウイルス感染.過体重.投薬など.特定の患者さんに複数の原因が併存していることもあります。