妊娠中の潜在性甲状腺機能低下症が胎児の神経知的発達に及ぼす影響は不明である。 大規模な症例対照研究の結果.潜在性甲状腺機能低下症の未治療妊婦の子供は.甲状腺機能が正常な妊婦に比べてIQスコアが7ポイント低下し.7〜9歳の子供の運動.言語.注意力の発達が遅れることが示された。 中国医科大学のグループによるレトロスペクティブな研究でも同じ結論が得られており.1268人の妊婦の血清を16〜20週でスクリーニングし.18例の純粋な潜在性甲状腺機能低下症（FT4.TPOAbが正常）と140例の正常妊婦を得.生後25〜30ヶ月でその子孫を追跡調査したところ.MDIとPDIが正常対照群に比べて9.98と9.23低下していた。 スコアの差は統計的に有意であった。 HB Xueらは.妊婦のTSH上昇の程度と子供の知的発達との関係を分析し.TSH>=3.93mIU/Lの妊婦の子供ではMDIとPDIが有意に低かったが.TSH<3.93mIU/Lの妊婦の子供では上記のスコアは正常対照群と有意差がなかった。 最近発表されたCATS研究の結果によると.平均12週3日でL-T4(150ug/日)介入を開始した潜在性甲状腺機能低下症または低T4血症の妊婦390人が3歳時の子供のIQを測定したところ.非介入群(n=404)と比較して出生時のIQに有意差はなかった。 この否定的な結果は.2つの理由に関係していると思われる：(1)介入開始が妊娠12週と遅かったこと.(2)妊婦の潜在性甲状腺機能低下症の重症度が低く.TSH平均値の中央値が3.8mIU/Lであったこと（対照群では3.2mIU/L）。