動静脈カテーテル治療では.大動脈から肺動脈へ（左から右へ）血液のシャントが行われます。シャントの量は.カテーテルの口径の太さと大動脈と肺動脈との圧力の段差に依存します。 出生直後はまだ肺動脈の抵抗が大きく.圧力も高いため.左から右へのシャントは少ないか.収縮期のみに存在する。その後.肺動脈の抵抗は徐々に減少し.圧力は大動脈よりかなり低くなり.シャント流量は増加する。肺動脈が右室ドレナージとカテーテルシャントの両方を受けると.肺静脈から左心室に戻る血液の量が増え.左心室の負荷が増大し.左心室の拡大.肥大.さらには不全に至る。 僧帽弁開口部を流れる血液が多すぎると.僧帽弁の相対的狭窄が起こります。肺静脈血の排出障害と圧力の上昇は.間質性肺水腫を引き起こす可能性がある。 上行大動脈と大動脈弓の内腔は.そこを流れる血流の増加により拡大し.これは肺動脈血流の増加にも反映される。長期にわたる肺血流量の増加は.小肺動脈の反射性けいれんを引き起こし.小肺動脈の壁の肥厚や硬化.内腔の菲薄化.肺循環抵抗の増大をもたらすことがある。 肺循環抵抗が増大し.肺高血圧症が進行すると.左から右へのシャントフローが徐々に減少し.やがて逆（右から左）シャントが起こり.胴体下部の動脈の酸素量が低下し.足指の先がチアノーゼを起こすようになるのです。長期の血流衝動は.動脈瘤や石灰化を起こすほど管壁を薄く.もろくします。また.感染や内膜炎を起こしやすくなります。近位肺動脈は管内圧力の上昇により動脈瘤の拡大を示すことがある。