生理的要因は主に遺伝に関係し、病理的要因は主に栄養失調、脳性麻痺、骨の発育異常などに関係する。 1.生理的要因：両親のどちらかが頭囲が小さい場合、それが次世代に受け継がれ、子供の頭囲が小さくなることがあるが、これは正常な生理現象である。 2.病的要因 (1)栄養不良：乳幼児が栄養不良になり、発育が遅れて頭囲が小さくなる。 (2）脳性麻痺：頭囲が正常より小さく、精神遅滞を伴う場合は、後天性脳性麻痺などの疾患が原因と考えられる。 (3)骨の発育異常：知能は正常であるが、病的な理由で頭囲が小さい場合、脳の発育は正常であるが、骨の発育が脳の発育に追いつかず、骨の関節が早期に閉鎖してしまう骨の発育異常が考えられます。 頭囲が小さい場合、生理的な要因を取り除いた後、親はすぐに子供を医者に連れて行き、原因を突き止め、的を射た治療をするよう勧められる。