2種類の腫瘍は.2つの転写因子（TFE3およびTFEB）の融合遺伝子の存在と関連している。Xp11転座はTFE3遺伝子の融合を引き起こし.t（6；11）はMALAT1-TFEBの融合を引き起こす。 t(6;11)腎細胞癌は.Xp11転位腎細胞癌よりも一般的ではありません。 大きく非特徴的である。 顕微鏡的には.Xp11転座腎細胞癌は肉芽腫様石灰化が散在する透明細胞の乳頭状に見えるが.t(6;11)転座腎細胞癌は内部に基底膜様沈着を有する両サイズの細胞の巣として見える。 免疫組織化学的には.CK.EMA.PAX8などの上皮系マーカーや尿細管マーカーの発現低下.Xp11腎細胞がん：メラニンマーカーやTFE3の部分発現.t（6；11）腎細胞がんはHMB45.メランA.カテプシンK.TFEBなどのメラニンマーカーの一定発現が認められる。FISHの結果.TFE3またはTFEBの融合遺伝子が検出された。