一般に、肝性脳症の臨床経過は、意識障害の程度、神経学的症状、脳波変化により、潜伏期、前駆期、前昏睡期、傾眠期、昏睡期の5段階に分類される。
1.0期：「潜在期」とも呼ばれる。 行動や性格に異常はなく、神経学的徴候（バビンスキー徴候など）もなく、脳波は正常で、心理学的検査や知能検査で軽度の異常がみられる程度である。
2.1期：「前駆期」とも呼ばれる。 不安、多幸感、無気力、睡眠逆転、健忘などの軽度の人格変化や精神異常がみられる。フラッタリング振戦（腕を前に伸ばしたときの不随意振戦）がみられることもある。 脳波はほとんど正常である。 この病期の臨床症状は明らかではなく、見過ごされやすい。
3.2 段階2：「前昏睡」とも呼ばれる。 眠気、異常行動（排尿・排便など）、不明瞭な言語、書字障害、見当識障害。 反射亢進、筋緊張亢進、足関節クローヌス、バビンスキー徴候陽性、振戦、脳波の特徴的異常などの神経学的徴候がみられる。
4.3 第3期：「嗜眠期」とも呼ばれる。 症状は嗜眠であるが、目覚めることができ、目覚めたときに反応することができ、しばしば錯乱や幻覚を伴い、さまざまな神経学的徴候が持続または増悪し、ふらつき振戦、筋緊張亢進、反射亢進、神経病理学的徴候が陽性であることが多い。 脳波に異常波形がみられる。
5.4 病期4：「昏睡期」とも呼ばれる。 患者は昏睡状態にあり、覚醒できない。 患者はひらひらした振戦を誘発するのに協力できない。 腱反射は亢進または消失し、筋緊張は亢進または低下する。 脳波は著明に異常である。
肝性脳症がある場合は、積極的に医師に相談し、医師の指示に従って合理的な治療を行う必要がある。