角膜移植は最初に成功した臓器移植の一つであるが.その理由は.正常な角膜には血管やリンパ管がなく.移植片が患者の体の免疫系に認識されにくいため.一般に拒絶反応を起こさないからである。 輸血が個人間でアレルギー反応を起こすことがあるように.同種角膜移植も免疫拒絶反応を起こすことがある。特に移植片が大きい場合.炎症期.角膜の新生血管がある場合.角膜組織の抗原に大きな違いがある場合などである。 リンパ球と抗体が移植片を攻撃して拒絶反応を起こし.変性.混濁.瘢痕形成.失明に至る。
患者の免疫系はさらに.移植片に対する感作リンパ球と抗体を産生します。