脳は精神活動を生み出す器官であり.現代の神経科学は.正常な脳の構造と機能が正常な精神活動を生み出し.逆に異常な精神活動が起こりうることを証明している。 前頭葉の認知機能が損なわれると.時間的・空間的に複雑な動作を完了することが困難になる。アルコール依存症によるビタミンBの不足は.内側視床と乳頭体の損傷を引き起こし.患者の近時記憶障害や見当識障害を引き起こす。統合失調症患者の視床は.磁気共鳴画像装置（MRI）スキャンで健常者よりも小さいことが判明しており.これが発症時の幻覚の原因のひとつと考えられている。 また.脳の神経生化学的研究から.統合失調症患者における幻覚.妄想.行動障害などの陽性症状は皮質下辺縁系におけるドーパミン（DA）の機能亢進と関連し.貧困思考.感情的無気力.意思の欠如などの陰性症状は皮質内層.特に前頭前皮質におけるDA機能の低下と関連していることが明らかになった. 食欲.不安.概日リズム障害.不眠.活動性の低下.性機能障害などである。 また.ヒトの遺伝子は3～4千万個しか存在しないが.学習や訓練.経験の蓄積.外部環境などの影響により.数兆～1兆個以上のシナプス結合を形成することができ.ヒトの脳には大きな可塑性があることを示しており.薬物療法や精神療法の治療基盤にもなっている。