WHO Manual on Standardized Testing and Diagnosis for Infertile Couples and the WHO Diagnostic Procedures for Male Infertilityによると.男性不妊の原因診断は16のカテゴリーに分類される。 このような患者では.性交後の尿を採取して検査すると.生きている精子が見つかることがある）。
2.精子と精漿の検査による診断：
(1)男性免疫性不妊症：運動精子の50％に抗精子抗体が付着している。
(2)原因不明の不妊症：性機能は正常で.精子や精漿の検査も正常である。
(3)単純性精漿異常：これらの患者では副生殖腺感染症やその他の病変は認められず.不妊の原因となる単純性精漿異常の意義は不明である。
（2）全身的な原因：全身疾患.アルコール中毒.薬物乱用.環境因子.最近の高体温症や毛様体ジスキネジア症候群（慢性上気道疾患の既往歴などで精子の運動率が悪い）など。
（3）先天異常：クリプトルキディズム.または精子異常を引き起こす細胞核型分析異常.精嚢および/または精管の先天性低形成による無精子症.および生殖能力に影響を及ぼすその他の先天異常が含まれます。
（4）後天性精巣障害：精巣萎縮症.おたふく風邪による精巣炎などによる精巣容積15ml未満.精子異常を伴う精巣障害など。
（5）精索静脈瘤があり.精液検査が正常であれば.原因不明の不妊症となります。
（6）男性付属腺感染による不妊：乏精子症.低精子症.異常精子症があり.以下の基準を満たす場合。
男性副乳腺感染症の不妊症は.上記のすべての検査が存在し.以下のいずれかの組み合わせが存在する場合に診断される：前立腺炎の既往歴または徴候；または精液検査の異常の既往歴または徴候；または射精精液の異常を伴う前立腺炎の症状；または各精液検査で少なくとも2つの異常。
(7) 内分泌の原因：性腺機能低下症の徴候があり.血液中の性ホルモン測定値が正常でFSHが正常値.テストステロンが低値.またはPRL測定値が繰り返し上昇することがある。 これらの症例では.視野.翼状片スキャン.LHRH.TRHなど.診断を明確にするためのさらなる検査が必要である。
4.その他.明確な原因が特定されないが.精液検査に異常が認められる場合.例えば乏精子症.弱精子症.異常精子症.無精子症などは.以下の基準に従って診断される：
（1）特発性乏精子症：精子は存在するが.精子密度が20×106/ml未満であるもの。 <25%.
（3）特発性奇形精子症：精子密度と生存率は正常であるが.正常な精子頭部の形態は30％未満である。
（4）閉塞性無精子症：精液検査で精子は認められないが.精巣生検で精索静脈瘤内の精子形成が確認される。精巣生検がなければ.正常な精巣容積（総容積≧30ml）と正常なFSHに基づいて初期診断が可能である。
(5) 特発性無精子症：精液中に精子が認められず.原因が特定されず.精巣容積の減少（総精巣容積<30ml）.FSHの増加.または精巣生検で精索静脈瘤に精子形成がないことを確認する。