乳癌の術後病理検査では.腫瘍の具体的な分類や名称.腫瘍の大きさ.断端がきれいに切除されているかどうか.リンパ節転移の部位や数.血管やリンパ管などの組織への浸潤の有無などの記載に加え.予後を示す重要な免疫学的指標があり.その分析によって治療の指針や予後を推定することができます。 以下は.各病院の検査で認められる一般的な免疫学的マーカーとその解釈である。 ER：エストロゲン受容体.陽性の場合は陰性の場合よりも予後が良好で.プラス記号が多いほどよい。 PR：プロゲステロン受容体.陽性の場合は陰性の場合よりも予後が良好であることを示唆する。 ERとPRは正常な乳腺上皮細胞に存在し.細胞が癌化すると一部または完全に消失します。 細胞がまだERおよび/またはPRを保持している場合.乳癌細胞の成長と増殖は依然として内分泌によって調節されており.これをホルモン依存性乳癌と呼びます。ERおよび/またはPRが欠損している場合.乳癌細胞の成長と増殖はもはや内分泌によって調節されておらず.これを非ホルモン依存性乳癌と呼びます。 両方が陽性であれば予後は良好で.例えば陽性と陰性の場合.エストロゲン陽性の方がプロゲステロン陽性より良好です。 両方陰性の場合は予後不良である。 陽性の場合は.術後または術前に内分泌療法を行うことができる。 Her-2（CerbB-2）：ヒト上皮成長因子受容体2で.がん原遺伝子の一つ。 その過剰発現.すなわちプラス記号の存在は.患者の予後が不良であることを示す。 また.腋窩リンパ節転移を起こしやすく.これらのホルモン受容体の両方が欠損している可能性も示唆する。 ホルモン受容体は.正常乳房組織では発現量が少ないが.乳癌組織では発現量が増加することがあり.乳癌の悪性度.リンパ節転移.臨床病期と正の相関があり.発現量が多いほど予後が悪い可能性がある。 しかし.フィッシュ検査でプラス記号が2つ以上あるものは.生物学的標的治療の可能性がある。 すなわち.トラスツズマブ（ハーセプチン）によるものである。 これらの3つはすべて.現在「トリプルネガティブ」と呼ばれる乳癌の陰性患者で.予後が比較的悪く.薬物療法が欠如している。 E-カドヘリン：E-カドヘリンはカルレティキュリンファミリーの膜貫通タンパク質アイソフォームであり.接着接合部に発現し.上皮細胞の完全性.極性.形態.組織の維持に重要である。 高発現は良好な予後を示す。 Ki-67index：細胞増殖に反応する増殖抗原で.その発現は乳癌の発生と進行に関連し.予後不良因子である。 値が高いほど予後が悪い。 P53：腫瘍抑制遺伝子で.変異があると予後不良を示す。P53の変異率が高い乳がん細胞は.増殖活性が高く.分化度が低く.悪性度が高く.浸潤性が高く.リンパ節転移率が高い。 CK5/6：CK5/6はサイトケラチンタンパク質であり.組織学的悪性度が高いほど.また腫瘍の病期が高いほど発現率が高く.一般的に陽性予後は不良である。 EGFR：上皮成長因子受容体であり.組織学的悪性度が高いほど.また腫瘍の病期が高いほど発現率が高く.一般的に陽性であり.臨床的予後不良を示唆する。 VEGF：血管内皮増殖因子.高発現は予後不良を示唆する。 TOP-II：DNAトポイソメラーゼII.高発現は腫瘍の高増殖と悪性を示唆する。