重症急性膵炎の経過は一定の規則性を持っています。 この病気の全経過は大きく3つの段階に分けられます。 1.急性反応期：発症から2週間程度までは.全身性の炎症反応を特徴とし.しばしばショック.急性呼吸窮迫症候群（ARDS）.急性腎不全.膵臓脳症などの大きな合併症を伴います。 腹痛や腹部膨満感に加え.全身の臓器機能が低下し.発熱.息切れ.呼吸困難.心拍数増加.血圧低下.ショック.乏尿.無尿.消化管出血.いらいら.喃語.昏睡などを呈することもあります。 人工呼吸器による気管挿管（切開）が必要な患者さんや.血液浄化療法が必要な患者さん.緊急手術が必要な患者さんも少なからずいらっしゃいます。 病気自体の進行のため.入院後も病状は徐々に悪化し.多臓器不全に陥ることもあり.この段階で死亡する患者さんもいて.重症急性膵炎の最初の死亡のピークとなります。 2.全身感染症：急性期を過ぎると.全身状態は徐々に改善され.短期間の「安定期」を迎えます。 しかし.この時点では膵炎が完治したとは言えず.膵周囲液.壊死性感染症.膵周囲膿瘍.出血など.膵周囲に多かれ少なかれ局所的な合併症が存在するため.膵炎が完治したとは言えない。 局所合併症の場合.特別な治療を必要とせず.経過観察しながら自己吸収で治る患者もいれば.穿刺排液で治る患者もいれば.感染.膿瘍.出血.腸瘻などの合併症で帝王切開手術が必要な患者もいます。 膵炎の特殊性から.術後は通常数ヶ月間（あるいはそれ以上）継続的な洗浄・排液が必要です。 出血.膿瘍.腸瘻などの合併症を発症し.時には複数回の外科的治療が必要になったり.少数の患者さんでは真菌感染.多臓器不全.あるいは重症急性膵炎の死亡の第2ピークである死亡に至ったりすることもあり得ます。 3.残留感染期：数ヶ月後の時期.主に全身栄養失調.後腹膜や腹腔内の残留膿腔の存在として現れる。