HIVは.ウイルス分類上.レトロウイルス科レンチウイルス属のヒト免疫不全ウイルス群に属します。 遺伝的多様性が高い理由は以下の4点です。 1.逆転写酵素のエラーレートが高く.誤って導入されたヌクレオチドの除去が複製に間に合わないため.およそ複製サイクルごとに1つのエラーが起こり.ウイルスの複製中にランダムな突然変異が発生する。 2.ウイルスの急速な複製.約100億のウイルス粒子を生成し.除去するために.1日あたりのHIV感染者。 宿主細胞性または体液性免疫を刺激することができるゲノムは.gp120 V3リング高変動領域のような変動の他の部分よりも高いように.3.宿主免疫圧の作用の下で選択.。 4.異なるウイルス株のDNA間の遺伝子組換え。 HIV遺伝子は約9.8kbの長さで.3つの構造遺伝子（gag, pol, env）.2つの制御遺伝子（tat trans activator, rev virulence particle protein expression regulator）.4つの付属遺伝子（nef negative regulator, vpr viral r protein, vpu viral u protein, vif virulence particle infectivity factor）から構成されています。 HIVは遺伝子ごとに変異の度合いが異なり.env遺伝子が最も変異率が高いウイルスです。 現在までに世界で流行しているHIVは.血清反応とウイルス核酸配列決定から.HIV-1とHIV-2の2種類に分類される。 HIV-1とHIV-2の間では.塩基配列の40-60％しか相同性がない。 HIV-1では.サブタイプ間の遺伝的分岐率は20％〜35％.同一サブタイプ内では7％〜20％である。 HIV-1は.エンベロープタンパク質をコードするenv遺伝子とカプシドタンパク質をコードするgag遺伝子の配列相同性から.M（メイン）.O（アウトライン）.N（ニュー.非M.非O）に分類されるが.そのうちMは.これまで A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, Kの11種類のサブタイプがある。 グループOは1990年にカメルーンとガボンから分離され.グループMの他の亜型とは50％しかアミノ酸配列の相同性がない。グループNは最近カメルーンの患者2人から分離されたばかりの新しいウイルス群で.系統樹ではグループMにもグループOにも属さないため.グループNと名付けられた。 HIV-2は生物学的にHIV-1と非常によく似ていますが.感染力が弱く.エイズの臨床的な進行が遅く.症状も軽いのが特徴です。 中国ではHIV-1が主流で.HIV-2にはA.B（欧米B）.B’（タイB）.C.D.E.F.Gの8亜型があり.異なる流行の組み換え型も存在します。 しかし.O型とN型はこれまで報告されていない。 HIVの亜型の早期発見・同定は.疫学調査.適時診断.新しい診断試薬の開発.新薬開発.ワクチン開発などに重要である。