低位肛門周囲膿瘍痔瘻手術の後遺症には、一般的に術後出血、肛門括約筋損傷、術後疼痛、肛門狭窄などがあります。
1.術後出血：低位肛門周囲膿瘍痔瘻の術中切除により、切除後の肛門周囲に外傷が形成され、外傷が回復した後、瘢痕組織が形成されるか、傷が治癒しない。 患者に便秘や下痢があると、外傷がさらに傷ついたり、傷口が裂けて術後外傷出血を起こすことがあり、このような場合は傷の治癒に影響を与えないよう、時間をかけて治療する必要がある。
2.肛門括約筋の損傷：低位肛門周囲膿瘍肛門瘻手術の過程で、肛門瘻に関係する部分を切除することになるが、肛門瘻は肛門括約筋の周囲に位置するため、手術によって肛門括約筋を損傷し、便失禁を引き起こす可能性がある。 手術中に瘻孔の位置を注意深く探ることで、この合併症の発生を抑えることができる。
3.術後の痛み：肛門の周囲には多数の知覚神経が分布しており、ここの知覚神経は敏感であるため、瘻孔を切除すると神経が刺激され、痛みが生じる。
4.肛門狭窄：低位肛門周囲膿瘍痔瘻の手術は、肛門周囲の皮膚や筋肉を損傷しやすく、術後の創傷治癒により瘢痕組織が形成され、肛門狭窄が生じることがあります。 肛門狭窄が生じた場合、術後の腸機能に影響を与えないよう、術後に定期的に肛門拡張術を行う必要がある。
肛門周囲膿瘍や痔瘻の低位手術では上記のような後遺症が生じる可能性がありますが、一般的には治療によって改善することが可能であり、肛門周囲膿瘍や痔瘻の患者さんは手術を行わなければ身体に大きな害を及ぼす可能性があります。 したがって、医師が手術を勧めた場合、患者は手術の後遺症を心配せず、手術を拒否しなければならない。