トキソプラズマ症は人から人へ感染する。 ひとつは、妊婦がトキソプラズマ症に感染し、胎盤を通して胎児に感染するもので、胎児の成長と発育に直接影響を与え、深刻な奇形を引き起こす。 この感染確率は約40％である。 これは先天性感染経路と呼ばれる。 また、臓器移植や輸血を通じて起こるヒトからヒトへの感染もある。 トキソプラズマ症の主な感染経路は、動物、特にトキソプラズマ・ゴンディに感染したネコを介したものである。 オーシストを含むトキソプラズマ・ゴンディの糞便、オーシストに汚染された食物や水との接触、損傷した皮膚や粘膜との接触が、この病気の主な感染源である。 ヒトへの主な感染経路は、トキソプラズマ・ゴンディを含む未調理の卵、肉、乳製品を食べることによる食物感染である。 これは後天性感染経路と呼ばれる。