インターフェロンには.抗ウイルス作用と免疫調節作用の両方があり.一定の割合の患者にウイルス複製の持続的な抑制.あるいはウイルスクリアランス（HBsAg陰性）を獲得させることができ.HBV関連肝硬変患者の肝細胞癌の発生率を有意に低下させることができる。いくつかの研究によると.同じインターフェロン治療を1年間行った場合.肝硬変患者のHBeAgクリアランス率は.非肝硬変患者のそれよりも有意に高く.それぞれ59％対24％であった。 肝硬変患者のHBe抗原クリアランス率は.非肝硬変患者よりも有意に高く.59％対24％であった。 したがって.禁忌がなく.肝炎の急性増悪がなければ.HBVDNA陽性の代償期の良好な肝硬変患者に対する抗ウイルス薬の第一選択薬としてIFNαを使用できると考える学者もいる。 投与量と治療期間：通常のインターフェロン500WIUを皮下.隔日；ポリエチレングリコール化インターフェロン（α-2a）180μgを皮下.週1回。 治療期間は1年である。 投薬中は.状態を注意深く観察し.インターフェロン投与に明らかな禁忌がある場合は.早期に投与を中止する。 ヌクレオシド類似体 このクラスの薬剤は.HBVに対して強い阻害作用を持ち.肝機能や肝組織の炎症.壊死.線維化病変を著しく改善することができる。 ラミブジン.アデホビル.エンテカビル.テビブジンなどがある。 現在.代償性肝硬変患者にラミブジンを持続経口投与することで.肝機能低下や原発性肝細胞癌（HCC）の発症リスクが低下することを示す試験があるが.この薬剤では耐性菌の発生率が比較的高いのに対し.アデホビルエステルやエンテカビルでは耐性菌の発生率が低く.長期経口投与に適している。