薬物療法が無効な場合
1.薬物療法が無効な場合.合併症がある場合.コンプライアンスが不良な場合は手術を考慮する。
2.抗TNF薬.高用量のグルココルチコイド.および/またはシクロスポリンを投与中の患者には.術後合併症のリスクを考慮し.段階的手術が推奨される。 しかし.患者のリスク層別化.全体的な臨床状態.医師の判断に基づいて個別に決定すべきである。
炎症
急性大腸炎で.穿孔の兆候や症状がある場合は.通常外科的治療を行う。
狭窄
1.小腸や吻合部の狭窄で.対症療法的な薬物療法が無効な場合は.内視鏡による拡張術が適応となる。
2.薬物治療や内視鏡治療が無効な症候性小腸狭窄や吻合部狭窄に対しては.外科的治療が適応となります。
3.内視鏡で十分に描出できない大腸狭窄では.外科的切除を考慮すべきである。
穿孔症
1.自然穿孔の患者は外科的治療が必要である。
2.腸壁膿瘍.腸間膿瘍.腸内膿瘍.後腹膜膿瘍の患者には.経皮的経皮的ドレナージの有無にかかわらず.抗生物質による治療を行う。
治療がうまくいかない場合は.腸管の切除を伴う.または伴わない外科的ドレナージを考慮すべきである。
3.腸瘻を合併している場合.または内科的治療を受けたが.まだ敗血症の局所的または全身的な徴候や症状がある場合は.外科的治療を考慮すべきである。
出血
安定している重大な消化管出血患者は.内視鏡検査と治療および/または介入療法を受けるべきである。 病状が不安定な患者は外科的検査を受けるべきである。
成長遅延
薬物療法に失敗し.著しい成長遅延がある思春期前の患者には外科的治療を考慮すべきである。
腫瘍形成
1.長期にわたる回腸・大腸型CD患者は.大腸内視鏡検査で経過を観察すべきである。
2.大腸の悪性腫瘍.非腺腫性異型過形成.高度異型過形成.多巣性低悪性度異型過形成に伴う病変や腫瘤を有するCD患者では.大腸全摘を考慮することがある。
3.CD患者の疑わしい病変（腫瘤.潰瘍など）は.特に小腸狭窄形成術を検討している患者では組織生検が必要である。
技術的な考慮点
1.切除が必要な腸管セグメントを有する患者に対しては.経験と技術が許せば腹腔鏡手術を行うべきである。
2.病変部切除後に一期的吻合が可能であれば.外科医が最も適切な吻合を決定する。
特定の病変に対する手術
1.回腸末端部.回腸絨毛.上部消化管
2.空腸.回腸近位部.回腸末端部.回腸絨毛に病変があり手術が必要な患者の場合.短腸症候群が発症していないか.発症の切迫性がなければ.一般に病変部位の切除を行う。
3.胃十二指腸症状がある場合.内視鏡による病変部の拡張術.バイパス術.狭窄形成術を考慮する。
大腸
1.CDの緊急手術には経腹的大腸切除術と終末回腸吻合術が望ましい。
2.選択的手術が必要な直腸の結腸病変のない患者は.単一の腸管セグメントに発生した場合は.分枝結腸切除術を受けることができる。
3.手術が必要な直腸病変に対しては.結腸全摘術またはストーマを伴う直腸切除術が主に行われる。
4.CDと確定診断された患者に対しては.大腸全摘+IPAAは通常推奨されない。