新生児胃洗浄術は新生児室でよく行われる手術であり、安全である。 胃洗浄術の際、口腔咽頭や胃粘膜が刺激され、粘膜損傷や不快感が生じることがあるが、通常、短期間で回復する。
新生児胃洗浄術は日常的な手術の一つであり、熟練した看護師が乳幼児に大きな害を与えることなく行っている。 胃洗浄の前に、潤滑剤を塗った胃管を鼻または口腔咽頭から挿入するが、これは非常に柔らかく、喉や胃の粘膜にほとんど刺激を与えない。
新生児の粘膜は非常にデリケートなので、チューブを深く挿入しすぎたり、胃洗浄液の温度が適切でなかったりすると、鼻咽頭や口腔咽頭の粘膜に軽度の損傷を与えることがありますが、短期間で回復します。