プロバイオティクスは一般的に普通の人には勧められない。 人間の腸管には、乳酸菌、ビフィズス菌、クロストリジウム・ブチリカムなどの正常な細菌叢があり、その中でも人体に有益な乳酸菌、ビフィズス菌などをプロバイオティクスと呼ぶ。 プロバイオティクスは、腸内フローラのバランスが崩れて下痢や便秘、消化不良などを引き起こしている人に適している。 普通の人には、プロバイオティクスは一般的に勧められないし、必要ない。 通常、人間の腸内細菌叢はバランスの取れた状態に保たれているが、プロバイオティクス製剤の盲目的な使用は、逆に腸内細菌叢のバランスに影響を与え、過剰摂取は腸内細菌叢障害を引き起こす可能性もある。 生体に害を及ぼさないためにも、使用する必要のある患者は、医師の指導のもとで使用量を調節し、やみくもに自己判断で使用しないことが推奨される。