慢性下痢の原因には、感染性のものと非感染性のものがある。
1.感染性要因：大腸菌、コレラ菌、赤痢菌などの細菌感染、ロタウイルス、ノロウイルスなどのウイルス感染、アメーバ、クリプトスポリジウム、シストソーマなどの寄生虫、カンジダ、アスペルギルスなどの下痢原因菌などの真菌感染。
2.非感染性要因
(1)薬剤：ネオスチグミン、チロキシン、リファンピシン、クリンダマイシン、フルオロウラシル、一部の抗生物質は下痢を引き起こすことがある。
(2) 胃疾患：進行胃癌、胃の大切除、慢性萎縮性胃炎、胃空腸吻合術など、胃内容物が腸管内腔に過剰に流入するために下痢を引き起こす。
(3) 腸管非感染性疾患：放射線性腸炎、虚血性腸炎、炎症性腸疾患、大腸憩室炎、腸管悪性腫瘍などによる下痢。
(4)膵臓、肝胆道系疾患：慢性膵炎、膵臓がん、肝硬変などが栄養吸収障害による下痢を引き起こすことがある。
症状が緩和されない場合は、早めに医師に相談し、病気の原因をはっきりさせた上で、治療方針を立ててもらうことをお勧めします。