臨床データや実験的研究の蓄積と総括により.妊娠時期の小さい赤ちゃんの原因は.栄養的な要因以外にも数多くあることが分かってきました。 母親の身長が低いと妊娠時期の赤ちゃんが小さくなる可能性があり.身長の低い母親は小さい赤ちゃんを産む可能性が高くなります。
ある調査では.妊娠低年齢群のお母さんの平均身長が156cmだったのに対し.正常新生児群では161cmと.非常に大きな差があることがわかりました。 多胎妊娠の場合.妊娠年齢が小さい赤ちゃんが生まれることが多いようです。
双子や三つ子の場合は小さめです。
双子の場合.1人は正常体重で.もう1人は妊娠年齢に対して小さい赤ちゃんということがあります。
これは.胎盤への血液供給が不均等で.血液供給が多い方が大きく.少ない方が小さいためか.2つの胎児間の血液の移動が原因である可能性があります。 また.慢性的な子宮内低酸素症も.妊娠年齢の小さい赤ちゃんの重要な原因です。
例えば.28週以前の経膣出血.重症妊娠高血圧症候群.血管疾患を伴う重症糖尿病.慢性心疾患や腎疾患.また.母体が高原にある場合や喫煙（1日5本以上）などは.胎盤の血流を低下させて胎児の慢性低酸素症や栄養欠乏を起こし.胎児の成長が悪くなり出生時のサイズが小さくなることがあります。 また.胎盤や臍帯は胎児に栄養や酸素を供給しているため.胎盤や臍帯に異常があると.胎児の成長に影響を与えることがあります。
胎盤に血管腫や小胎盤.胎盤異形成がある場合.胎盤の血管の閉塞や臍帯の血管異常.子宮への血流不足が栄養や酸素の供給に影響を与え.子宮内発育遅延を引き起こすことがあります。 子宮内感染も胎児発育遅延の重要な原因のひとつです。
病原体はまず母体から子宮頸部や血流を介して胎盤に侵入して炎症を起こし.それがさらに胚や胎児に侵入して胎児の発育遅延や奇形を引き起こします。
一般的な病原体としては.各種ウイルス（風疹.サイトメガロウイルス.ヘルペスウイルス.コクサッキーウイルス.オーファンウイルス.B型肝炎ウイルスなど）.トキソプラズマ・ゴンジ（犬や猫との接触で感染）などがあり.妊娠年齢の低い赤ちゃんの原因になることがある。
また.特定の染色体異常.遺伝性疾患.先天性疾患も.低身長児が生まれる原因となることがあります。