胎児心奇形の原因には.遺伝的要因.病原微生物的要因.化学的要因.物理的要因が関連している。 母体要因：1.母体糖尿病.結合組織病（全身性エリテマトーデスなど）
2.妊娠初期のウイルス感染（特に風疹ウイルス）.投薬歴
3.妊娠初期の放射線・化学物質への曝露
4.母体高年齢（35歳以上）.異常妊娠.早発症心臓病の家族歴.早発症心臓病の出産歴など
2.胎児要因：1.他臓器の胎児奇形：例えば水腫.単臍動脈.等々です。
2.染色体異常
3.胎児心拍数異常
4.胎児水腫
5.羊水異常
6.子宮内発育遅延。