この病気の症状は多彩で.多くの消化器.呼吸器.耳鼻咽喉科の病気と混同されることが多いため.患者さんだけでなく医師もGERDの可能性を見落としやすく.誤診・誤治療を招きやすいと言われています。
病気の進行段階により.一般的には以下のような症状が見られます。 胃食道期：このステージのGERDで最も多い症状は.主に食道で起こる胸焼けと酸の逆流です。
胸焼けは.前胸部や心窩部に灼熱感を感じる場合です。
酸の逆流は.吐き気や嘔吐などの症状がないのに.腹部から口へ酸があがってくるのを感じることです。
また.患者さんによっては.胸の痛み.胸の締め付け感.消化不良を感じることもあります。 咽頭期：逆流が悪化し.上部食道や咽頭に病変が生じると.急性・慢性咽頭炎と同様の症状が現れます。最も典型的なのは原因不明の慢性咳嗽で.通常は乾性であり.呼吸器科や耳鼻科で繰り返し治療してもあまり改善しない場合が多く.中には夜間咳嗽を繰り返し.安静が妨げられる患者さんもいます。
また.患者さんは.のどのヒリヒリ感.異物感.のどの痛みなどの不快感を感じることもあります。 口腔・鼻腔期：逆流がさらに悪化すると.口腔・鼻・中耳の粘膜が病変し.鼻水.くしゃみ.鼻づまり.耳鳴りなどの症状が現れ.中耳炎に移行することもあります。 喉頭気管期：逆流したものが気管に入ると.咳.痰.息切れ.息苦しさなどの症状が現れます。
症状が喘息発作に酷似しているのに.呼吸器科で喘息治療を受けても結果が出ない患者さんがたくさんいらっしゃいます。
この段階まで進行すると.すでに重症化しており.患者さんのQOL（生活の質）を著しく低下させ.命にかかわる喉頭痙攣を引き起こすこともあります。