脳幹梗塞の入院期間は、一般的に重症度や合併症などに関係する。
1.軽症：一般的に重篤な臨床症状がなく、合併症もないため、入院期間は通常より短く、7～10日程度で済む。
2.重篤な状態：例えば、意識障害、片麻痺、肺感染などの合併症がある場合、治療期間は長くなる。 病状が安定した後、リハビリテーション科に移され、1～3ヶ月の期間、リハビリ訓練を受ける必要がある。
脳幹梗塞の患者は、適時に治療を受け、治療に最適な時期を逃さず、専門医の指導のもと標準的な治療を受け、予後を良好に保つ必要がある。