大腸内視鏡検査は観察範囲が広く、肛門内視鏡検査は観察範囲が狭いため、大腸内視鏡検査後に肛門内視鏡検査を行う必要はない。 肛門鏡検査は主に肛門から入り、肛門の内部粘膜、直腸の一部とその病変を観察する。 腸内視鏡検査も肛門から入りますが、腸内視鏡検査の観察範囲が広く、肛門、直腸、結腸も観察でき、肛門鏡では観察できない部分まで観察できるので、腸内視鏡検査をすれば、患者は肛門鏡検査をする必要がありません。 腸管機能障害、腹痛、血便、消化不良などの不定愁訴がある場合、あるいは腸管ポリープ、家族性大腸がんなどのハイリスク因子がある場合、病変の発見が間に合わず治療が遅れることがないよう、定期的に大腸内視鏡検査を受けることが重要である。