砂仁は湿を解し胃を開く（湿を除き胃腸機能を正常化する）、脾を温め下痢を止める、気を整え胎児を落ち着かせる、中部の湿濁、心窩部ふくよかで空腹感がない、脾胃の冷えなどを治療する効能があり、通常煎じて服用する。
砂仁は伝統的な漢方薬で、味は辛、温、脾、胃、腎の経絡に属し、湿を化して胃を開き、脾を温めて下痢を止め、気を整えて胎児を安定させる作用がある。
使用方法は通常、他の薬と一緒に煎じ、有効成分の揮発を防ぐため、砂の実は後で置く必要がある。
湿濁閉塞（脾胃の運化作用に異常があり、脾胃に湿濁がたまる）、飢餓感のない上腹部膨満感（胃部膨満感）、脾胃の冷え、嘔吐・下痢、妊娠閉塞（妊娠初期の悪心・嘔吐・めまいなどの反応）、胎児の不穏などの治療に用いられます。
この薬の副作用と禁忌は明確ではないので、医師の指導のもとで使用を調整することが推奨される。