個人差があるため、絶対的な最速・最良の薬はなく、それぞれの状況に応じて適切な薬を選択する必要がある。 筋萎縮によく使われる薬としては、糖質コルチコステロイド、免疫抑制剤、生物学的製剤、筋栄養剤などがある。
1.副腎皮質ステロイド：プレドニゾンなど、炎症反応を抑制し、筋萎縮による炎症性ミオパチーに効果がある。
2.免疫抑制剤：シクロホスファミドなど、一般的に長期維持療法として自己免疫反応による筋萎縮に用いられる。
3.生物学的製剤：アダリムマブなど、筋萎縮を引き起こす難治性の炎症性ミオパチー患者によく用いられる。
4.筋肉に栄養を与える薬剤：クレアチン、ビタミンE、コエンザイムQなどが筋萎縮の治療に用いられる。
筋ジストロフィー患者にとって、筋力増強のための運動も非常に重要であることは注目に値する。 上記の薬剤のほとんどは処方薬であり、一定の副作用があるため、医師または薬剤師の指導のもとで選択する必要がある。