新生児水腎症の消失時期は明確に定義されていない。 少ない症例では、通常出生後6ヵ月以内に消失する。 多量の体液が貯留し、腎機能に異常がある場合は、通常、自然に消失することはない。 1.貯留液が少量で尿路に異常がない場合、この種の水腎症は自然治癒する傾向がある。 定期的な超音波検査が推奨され、多くは生後6ヵ月以内に消失する。 2.腎機能異常を伴う多量の水腎症：一般的な原因として、骨盤尿管接合部の閉塞、膀胱尿管逆流などがある。この種の水腎症は通常自然治癒しないので、早めに医師に相談して原因をはっきりさせ、医師の指導のもと、それぞれの状況に応じた治療計画を立てる必要がある。 水腎症の新生児は、症状の悪化を避けるため、積極的に医師の診察を受けるべきである。