よもぎ生姜湯は整気、散寒、温経止血（人体の経絡を温め、体内の出血を止める）の作用があるが、代用茶に属するため、治療効果は限定的である。 ヨモギは温性で、月経を温めて出血を止める作用があり、冷えを散らして月経を調整する。主に冷えによる出血、月経障害、月経困難症、および胎児が落ち着かないさまざまな原因の治療に用いられる。 生姜には寒を散らして症状を緩和する作用、脾胃を温めて嘔吐を止める作用（脾胃を温めて胃腸の冷えによる嘔吐を治療する）、肺を温めて咳を止める作用（肺を温めて咳を止める）があり、主に肺や肺の風寒、嘔吐、咳の症状に用いられます。 よもぎ生姜湯は両薬の効果を合わせ持ち、主に脾胃の寒滞による風寒邪、嘔吐、下痢、経絡の寒凝による月経困難症に用いる。 ただし、固熱症候群や陰虚（体内の陰と精が不足し、火が亢進している状態）の人は、よもぎ生姜湯の使用に注意が必要である。 同時に、茶飲料の役割は限られており、患者の状態が深刻であるなど、薬物の代わりになることはできないので、専門の医師の指導の下で治療する必要がある。