脊髄炎の原因は不明であり、現在のところ、主に感染、ワクチン接種、自己免疫が関係していると考えられている。
1.感染：感染は脊髄炎の発生を誘発し、感染後脊髄炎を引き起こす。 ほとんどの患者は、脊髄症状が出現する1～4週間前に、発熱、上気道感染、下痢、その他のウイルス感染の症状がみられる。
2.ワクチン接種：ワクチン接種により体の免疫機能の一部が異常をきたし、骨髄炎を発症することがある。
3.自己免疫因子：一部の患者では、ウイルスなどの病原体が脳脊髄液や脊髄から分離されず、その発生が自己免疫反応と関連している可能性がある。
骨髄炎が発見された患者は、病状を長引かせないためにも、早めに医師に相談し、医師の指導のもとで積極的に治療することが推奨される。