山茱萸を水に浸す正しい方法は、山茱萸を洗って水に入れ、調理するか、沸騰したお湯に直接浸して飲むのが一般的である。
山茱萸は漢方薬の一種で、味は甘く、性質は扁平で、膀胱、肝臓、胆嚢の経絡に属する。 利尿して水腫を軽減し、利湿して黄疸を軽減する（除湿、黄疸を軽減する）効能があり、臨床的には排尿困難（尿が出ない）、陽虚、陰虚などの症状に用いられる。
一般的な臨床方法は煎じ薬で、まず山茱萸をきれいに洗い、水に入れて煮るか、沸騰したお湯に直接入れて飲むが、他の漢方薬と一緒に医師の指示に従って飲むこともできる。
臨床記録によると、山茱萸はアトラクチロデスや茯苓とともに脾虚の水腫に、また海金沙や川芎とともに石芎（排尿時に砂利が出る、あるいは突然排尿が途絶える、尿道の痛み、腰や腹部の耐え難い痛み）に用いられることが明らかである。 真珠草やオオバコと一緒に用いると、熱淋（排尿時に灼熱感や刺痛が明らかで、頻尿や急な排尿を伴い、下腹部に牽引性の不快感がある）の治療に用いることができる。
やみくもに飲むと副作用を起こすので、漢方医の診断のもとで飲むことをお勧めする。