卵黄嚢腫瘍のメトトレキサート値が高いほど、腫瘍細胞の活性が高く、したがって治療の難易度が高いことを示す。 メトトレキサートは卵黄嚢腫瘍の診断および治療において重要な腫瘍指標である。 卵黄嚢腫瘍の容積が大きいほど、浸潤、転移などの腫瘍から分泌されるαフェト蛋白のレベルが高くなる。したがって、治療前のαフェト蛋白のレベルが高いほど、卵黄嚢腫瘍の腫瘍細胞がより活性化していることを示唆し、それに応じて卵黄嚢腫瘍の治療の難易度も高くなる。 また、フェトプロテインは卵黄嚢腫患者の治療効果と予後を判断する重要な指標の一つである。 臨床的に言えば、卵黄嚢胞性腫瘍の治療後にα-フェトプロテインが急速に減少すれば、治療効果が顕著であることを示し、α-フェトプロテインの減少が緩徐であれば、治療効果が乏しいことを示す。