腸管多発性過形成ポリープの治療には、大腸内視鏡下ポリープ切除術、または外科的病変部位の大腸切除術があり、術後は大腸内視鏡による経過観察が必要である。
1.大腸内視鏡下ポリープ切除術：腸ポリープは大腸内視鏡下ポリープ切除術を行うことができ、主に高周波治療や結紮術を用い、この外科手術は患者への害が少なく、回復が早い。異型過形成上皮組織が粘膜筋層に浸潤しておらず、ポリープの先端部に明確な切除線があり、病変が高分化型であれば、内視鏡的切除術を行い、内視鏡による綿密な経過観察が可能である。
2.手術：大腸内視鏡的切除がうまくいかなかった場合、ポリープがある場合、家族性腸管ポリポーシスの場合は、病変のある腸管を切除する手術が推奨される。 経過観察の治療はポリープの組織型によって異なる。
腫瘍の浸潤が深く、ポリープの先端の境界が不明瞭で、病変自体の分化度が低い患者では、大腸部分切除の適応となる。 粘膜筋層への腫瘍浸潤はリンパ管に浸潤する可能性があり、リンパ節転移の可能性が高くなるため、このような患者はさらに評価する必要がある。
腸にポリープが多発している場合は、積極的に受診して病型や診断名を明らかにし、医師の指示に従って適切な治療法を選択することが勧められる。