多嚢胞性肝臓の最も深刻な結果は、肝機能に影響を及ぼし、肝不全を誘発することである。 多嚢胞性肝臓の治療が間に合わず、病気が進行すると、肝機能への影響が大きくなり、肝細胞を傷つけ、このような患者は肝不全を引き起こしやすく、最終的には、肝移植によって多嚢胞性肝臓を摘出し、肝臓の正常な代謝を維持できる正常な肝臓を移植する必要が生じることがあります。 多嚢胞性肝臓はまた、多嚢胞性腎臓のような腎不全のような状態を伴うことがあることも特筆に値する。 現在のところ、ほとんどの多嚢胞性肝臓は重篤なものではなく、通常の治療でコントロール可能であるが、病院で定期的に検査を受け、医師の指導のもとで治療を行う必要がある。