免疫系障害は必ずしも治るとは限らない。 軽度の免疫系障害は治るが、重度の免疫系障害はまだ治らない。免疫系障害には免疫機能亢進症と免疫機能低下症がある。 免疫系疾患には、免疫機能亢進症と免疫機能低下症があり、軽度の免疫系疾患は特定の治療で治癒する可能性があるが、重度の免疫系疾患は現在の治療では治癒できない。 免疫機能亢進を特徴とする疾患には、全身性エリテマトーデス（SLE）、進行性硬化症、乾燥症候群、関節リウマチなどの自己免疫疾患がある。これらの自己免疫疾患の多くは、遺伝、環境、感染症などの要因によって免疫系が障害され、これらの免疫系障害によって人体内で自己抗体が産生される。 これらの自己免疫疾患のほとんどは有効な治療法がないが、適時に標準化された治療を行うことで、一般的に予後を改善し、病気の進行を抑えたり、症状を緩和することができる。 免疫系疾患の患者は、通常の病院のリウマチ科や免疫科を受診し、詳細な診察を受け、医師の処方に従って治療を受けることが推奨される。