モリンガの種子は植物の種子であり、明確な治療効果があることを示唆する研究はなく、ある程度の栄養価を提供することができる。 モリンガの種子の総糖分は6.9％～9.5％、タンパク質含有量は36.2％～38.7％、脂質含有量は33.8％～38.2％、カリウム含有量は515.3～617.6mg/100g、カルシウム含有量は95～135.3mg/100g、鉄含有量は2.9～3.5mg/100gで、ビタミンAが豊富である、 ビタミンEなどが豊富である。 モリンガの種子は、オイルとして抽出することも、さやから取り出して調理したりローストして食用にすることもできる。 ただし、モリンガの種子にはアルカロイド、モリンガ・フラボノイドが含まれており、高血圧、糖尿病患者、妊娠中の女性は、医師の指導の下で摂取するのが最善である。