臨床的には、カンピロバクターによる腸炎はカンピロバクター腸炎と呼ばれ、治療には主に一般治療とフラゾリドンの塗布などの薬物療法がある。 薬物療法は医師の指導のもとに行う。
1.一般治療：この病気は伝染性があるので、まず消化管を隔離し、患者の糞便を十分に消毒し、他の人に感染させないようにする。
2.薬物治療
(1)原因薬物療法：カンピロバクターはエリスロマイシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、リンコマイシン、フラゾリドンなどの薬剤に感受性があるため、医師が処方した上記の薬剤を治療に使用することができるが、乳幼児は骨の発育に影響を与えないように、フラゾリドン、キノロン系抗菌薬の使用を避けるようにする。
(2)対症療法：下痢、腹痛などの症状が強い患者には、モンテルカスト、イブプロフェンなどの治療薬を処方し、患者は安静を心がけ、食事は水分-電解質バランスを保つため、水分補給の必要性に応じて消化の良い半流動食を選択する。
カンピロバクター腸炎は自己限定性で、症状が軽い患者は治療を必要としないが、吐き気、発熱、腹痛などの深刻な不快症状がある場合は、適時に医師に相談し、血液検査、便検査、便培養などの関連検査、診断、積極的な治療を改善し、病状を遅らせないようにする。