四輝散と柴胡朔肝散は、成分、特異的効能、適応症に違いがある。
1.成分：四輝散は柴胡、桂枝茯苓丸、甘草、芍薬の4種類の漢方薬から構成されている。 柴胡加竜骨牡蛎湯は柴胡、桂枝茯苓丸、甘草、芍薬の4つの漢方薬に加え、陳皮、桂枝茯苓丸、芍薬甘草湯を配合したもので、柴胡加竜骨牡蛎湯は柴胡、桂枝茯苓丸、芍薬甘草湯を配合したものである。
2.特効：四輝散と柴胡朔肝散は共に散肝整気の作用があるが、四輝散は散熱、柴胡朔肝散は活血解痛の作用もある。
3.効能：四輝散は手足に熱がなく、下痢や赤痢、難産（腹部の痛み）、疝痛（疝痛・肋骨の辺りの痛み）など、熱邪の亢進によって起こる症状に適応する。 柴胡桂枝乾姜湯は肝気の滞りによる胸つかえ、蟠肋部痛、易怒性などに適応する。
四輝散と柴胡朔肝散の副作用ははっきりせず、その中で四輝散は処方漢方薬と専売漢方薬の両方が使えるが、柴胡朔肝散は漢方薬の処方漢方薬であり、両薬の使用は専門の漢方医の指導が必要である。