早期腎盂癌の予後は比較的良好で、積極的な治療により臨床的な回復が可能であるが、個人差があり、1年無再発生存率は約90％、1年腫瘍特異的生存率は約92％とする研究もある。
早期腎盂がんは、ほとんどが筋層非浸潤性上部尿路尿路上皮がんで、リンパ節転移や遠隔転移のないものを指す。 この時期、腫瘍組織はより限られており、転移は通常起こらないため、積極的な治療後のコントロールが容易である。
腎盂癌は尿路上皮から発生し、その生物学的特徴は多発性で再発しやすいことである。 尿管や膀胱の粘膜も尿路上皮であるため、腎盂癌は尿管や膀胱の腫瘍を伴うことが多い。 したがって、その治療は主に手術で行われ、腎盂癌の根治手術は、患側の腎臓、全尿管、膀胱の一部を含む半尿管切除術で行われることが多い。
術後は腫瘍の再発率を下げるため、状況に応じて膀胱内化学療法や免疫療法（エピルビシン、BCGなど）を行う。
中国のいくつかの研究によると、腎盂癌の術後再発期間の中央値は12ヶ月（すなわち50％の患者が再発する期間）であり、17.2％の患者が再発を経験し、そのうち80％の再発患者は術後2年以内に出現したと主張している。 しかし、明確な結論はまだ出ていない。 また、早期腎盂癌の1年無再発生存率は約90％、腫瘍特異的1年生存率は約92％とする研究もある。
結論として、腎盂癌は術後に再発しやすく、定期的な検査が必要である。 腎盂癌術後の患者さんは、定期的に病院を受診して状態を評価し、医師の処方する治療（膀胱穿刺による化学療法など）に協力し、医師の指示に従って状態を確認し、異常があれば治療を行い、病状を遅らせることのないようにすることが推奨される。