肝性脳症は臨床的に0期潜伏期、1期前駆期、2期前昏睡期、3期傾眠期、4期昏睡期の5段階に分けられる。
肝性脳症は、振戦の有無、脳波検査、病理学的徴候検査、ジストニック腱反射検査、中枢機能判定によって病期分類される。
1.0期すなわち潜在期：振戦がなく、脳波が正常で、病理学的徴候が陽性でなく、ジストニアと腱反射が正常で、行動と人格に異常がなく、精神知能にのみ異常がある。
2.1 前駆期：振戦、脳波異常、病的徴候陽性なし、筋緊張および腱反射正常、軽度の人格および精神異常（不安、健忘、睡眠逆転など）。
3.2 前昏睡期：振戦、異常脳波、陽性病理徴候、筋緊張および腱反射の亢進、行動異常および見当識障害、眠気、錯乱。
4.3 昏睡期：ふらつき振戦、脳波異常、病理学的徴候陽性、筋緊張亢進と腱反射、覚醒可能な眠気、混乱。
5.4 昏睡期：ふらつき振戦なし、脳波異常、陽性病理学的徴候なし、浅い昏睡では筋緊張と腱反射の亢進、深い昏睡では筋緊張と腱反射の低下、昏睡中に覚醒できない。