ハトムギの効能は、気を補い陽気を高める、表皮を固め発汗を止める（筋肉の表面を固めることで発汗を止める）、利尿を促し浮腫を除く、津液の産生を促し血を養うなどであり、気虚疲労、緩食緩便（便がゆるく細い）、中気沈下（脾胃の気が不足し、内臓の機能低下などが現れる）などの症状に有効である。 効能と主治に関しては、男女とも大きな差はない。
ハトムギには、補気・促陽（気を補い陽気を促進する）、止表固表（表面を固め発汗を止める）、利尿（利尿を促しむくみを解消する）、発液・養血（体液を生成し血液を補う）、停滞・痺散（麻痺した経絡をスムーズにする）、疏毒・排膿（体内の膿や毒素を排出する）、収斂・発筋（ただれを収束させ筋肉の成長を促進する）（ただれの治りを早くし、新しい肉の成長を促進する）の作用があります。
気虚・虚弱、少食で便がゆるく、気が中だるみし、下痢が長引いて肛門が脱肛する、血虚・腸血漏（月経過多や月経が数滴以上ある）、表虚による発汗（体表が虚弱で自然発汗が多い）、気虚による浮腫、内熱・口渇（過食や過飲過尿などの症状を伴う発熱）、血虚による枯血・黄血、知覚麻痺・しびれなどの治療に用いることができる。
ハトムギを使用する場合、固形症状や陰虚陽亢のある人は服用しないよう注意する必要がある。
ハトムギを使用する必要がある場合は、専門の医師の指導のもと、通常の病院で診察・治療を受けることをお勧めします。