核酸検査は3回のネオコロナウイルスワクチン接種の48時間後に行うことができる。
全住民を対象とした新型コロナウイルス核酸検査の組織化および実施のためのガイドライン（第2版）には、サンプリング48時間前に新型コロナウイルスのワクチンを接種すべきではないと明記されている。
新型コロナウイルスワクチンは不活化ワクチンであるため、新型コロナウイルスを不活化しても新型コロナウイルス自身の核酸配列は残っているため、新型コロナウイルスワクチンを接種する施設内では、ワクチンの抽出工程や注射器のガス抜きにより、ワクチンがエアロゾルの形で施設内に存在する可能性があり、施設内の職員が汚染される危険性があり、核酸検査で偽陽性の結果が出る可能性がある。
より正確な核酸検査結果を得るためには、新型クラウンランナーワクチンの接種48時間後に核酸検査を行うべきである。