ハトムギは漢方薬の一種で、水中では薬効に限界があり、治療効果が得られないことがあるため、煎じ薬を使用することをおすすめします。
ハトムギは、気を補い陽気を促進し、津液を生成して血を養い、筋肉の表面を固めて発汗を止める作用があり、気虚疲労、食が緩い（便が細く形が悪い）、中気がたるむ（脾胃の気虚で内臓が下垂する様子）、下痢が長引き肛門が脱出する、出血性出血で便から血が漏れる（過多月経や数滴以上の月経）、表虚発汗（筋肉の表面が弱いため頻回に自然発汗する）、血虚で色が黄色っぽいなどの治療に用いられます。
ハトムギは通常煎じ薬で服用し、煎じ汁の効果は限定的である。
漢方薬はエビデンスに基づいた治療を重視するため、自己判断で服用すると身体に不調をきたすことがあるため、漢方専門病院で治療を受けることを勧める。