精子頭部の奇形率が高いのは、精子細胞の損傷、精索静脈瘤、染色体異常などが原因である可能性があり、これらは薬物療法で治療できるが、染色体異常の場合は顕微鏡精子回収による人工授精しかない。
1.精子細胞の損傷：病原菌の生殖腺感染により、精子細胞が損傷され、高率に精子頭部の奇形が生じる。 外用洗浄ローションで洗浄し、医師の処方に従ってロキシスロマイシンカプセルやレボフロキサシンカプセルを内服して治療する。
2.精索静脈瘤：患者は陰嚢内容物への血液供給が強いため腹圧が上昇し、精索静脈瘤となり、血流の増加により温度が上昇し、精子に影響を与え、精子頭部の奇形率が高くなる。 舞子嶺錠、ジオスミン錠、ヘパチス・サポニンナトリウム錠などの内服薬を医師の処方に従って服用することで治療できますが、重症の場合は外科的治療が必要になります。
3.染色体異常：放射性物質への被曝による染色体異常は精子の質に影響を与え、精子頭部の奇形率が高く、これは治療不可能で、顕微鏡で精子を採取し、異常精子を除去した後、人工授精を行うしかない。
精子頭部奇形率の高い患者は、他の要因による場合もあり、異なる治療法が必要となる。 定期的な通院による適時の治療、禁煙・禁酒、平日の適度な運動などが推奨される。