BCG接種は、左右どちらの腕でも特に違いはなく、主に上腕外壁の三角筋の中央やや下に皮内注射する。 接種後約2週間で、局所の発赤、腫脹、浸潤が現れ、膿、小潰瘍が形成された場合は、感染を防ぐために1％ゲンチアナバイオレットを塗布することができる。 一般的にかさぶたの後8~12週間。 局所のリンパ節が腫大し、軟化して膿疱を形成している場合は、速やかに診断し、治療すべきである。 結核、急性感染症、腎炎、湿疹、免疫不全症の患者は接種禁止。 BCGワクチンは通常、新生児の出生24時間後に接種し、通常は1回のみ注射する。 早産や出生時の窒息などで接種が間に合わない場合は、生後3カ月以内に補充する。