現在のところ、菊の副作用と禁忌は明確ではなく、医師の処方に従って薬を使用する。
菊の花は甘く、苦く、やや冷たい性質がある。 肺経と肝経に属する。 風熱を散じ清熱し、肝を鎮めて眼を冴えさせ、熱と毒素を取り除く効能がある。 風熱の風邪、頭痛やめまい、目の充血や腫れ、目のかすみ、ただれ、癰、毒などに用いる。
菊花は主に風熱証や温病の初発症状に用いる：本剤は身が軽く、淡明で、肺経や表皮の風熱を清熱・消散する作用が長く、主に風熱証や温病の初発症状に用いるが、桑葉と性質や作用が似ているが、消散力はやや劣り、併用することが多い。
肝陽亢進（肝陽が強く、めまい、立ちくらみ、頭痛などの症状を引き起こす）の治療にも用いることができる証：本品の性質は寒性で、肝熱を清め、肝陽を鎮めることができる。 陰虚陽亢による頭痛やめまい、耳鳴り、物忘れによく用いられる。 サンザシ、カシアシード、夏空草と併用する。
また、目の充血、腫れ、痛み、かすみ目にも用いることができる。本剤は、風熱による目の充血、腫れ、痛み、あるいは肝火による目の炎症（目が光を怖がり、涙を流すことが多い）による目やにや涙もろさに対して、トリビュラス・テレストリス、クチナシ・ジャスミノイデス、セミの変態とともに用いることが多い。 枸杞子、熟地黄、山茱萸とともに用い、肝腎の精血不足、眼精疲労、目のかすみに用いる。
また、ただれ、癰、毒素に用いる。味は苦くやや冷たい。 熱を取り除き毒素を解毒する作用があり、熱や毒素を伴うただれや潰瘍の治療に内服、外用するのに適している。
医薬品の使用は専門家の指導のもとで行うべきで、無許可で使用することはできない。