神香舒気薬と木香順気薬の違いは、薬の成分、効能、作用にある。 例えば、神香舒気丸は気を鎮め、憂鬱を解消し、胃の痛みを和らげる効能があり、木香順気丸は気を動かし、湿を解消し、脾胃を強化する効能がある。
1.成分が違う：神翔舒気丸は神翔、仙水、清脾、柑子、柴胡、烏薬、木薬、玉金など；木香順気丸は木薬、砂実、仙水、檳榔子、甘草、陳皮、防風など。
2.効能の違い：神香舒肝丸は主に肝気滞、肝胃不和の治療で、胃と心窩部の膨満感と痛み、両心窩部の膨満感と痛みや疼き、嘔吐と呑酸（胃酸を上方から口腔咽頭へ呑み込む）などによるもの；木香順気丸は脾胃中阻の湿邪の治療で、胸と横隔膜のふくらみによる脾胃不和、心窩部（胃と胃）の膨満感と痛み、腹鳴（おなかが鳴る）、直腸（食欲がない、食事量が減る）などによるもの。
薬物療法が必要な場合は、医師の指導のもとでエビデンスを見極めながら使用することが必要で、やみくもに自己判断で薬を使用するのではなく、副作用を起こさないように注意する必要がある。