腎結石の遺伝的特性はあまり関係がなく、遺伝子変異の存在による原発性高シュウ酸尿症などの病態では、ごく早期に両方の腎臓に多発性の結石を呈することがある。 しかし、腎結石の発生に遺伝的要因が支配的であるわけではない。 腎臓結石の発生には地理的な要因があり、中国の尿路結石の発生率は全体で1％から5％、南部では5％から10％と高い。 腎臓結石の発生に影響する因子は多く、体内代謝異常、尿路閉塞、感染、薬物使用、生活習慣などが結石形成の主な原因である。 高血中カルシウム、高尿酸、尿量の減少などの体内代謝。 また、局所感染や尿路閉塞も結石の素因となり、結石は感染の増加にもつながります。 メトトレキサート、ケイ酸マグネシウム、アセタゾラミドなどの特定の薬剤は結石の発生に関連する可能性がある。 さらに、座りがちな生活、長時間の立ち仕事、水分摂取量の少なさなどの生活習慣も結石形成の要因となる。